澳洲MCRI儿童研究所利用大数据解密DNA

澳大利亚默多克儿童研究所(MCRI)正在试图加强自己的数据存储能力,因为他们在下一代DNA测序技术研究中遇到了大数据问题的困扰。

MCRI是全球致力于研究DNA测序技术的医学研究中心之一。这种技术可以为整个人类基因组进行测序,同时也让MCRI有了分析这些大数据集的能力。

该研究所早在2010年开始研究下一代DNA测序技术,为加快各种儿童发展障碍的诊断。

MCRI副主任Andrew Sinclair在电子邮件中告诉ZDNet记者:“每次对一个基因进行测序是非常费力又昂贵的——我们也不知道选择哪个基因。有了下一代测序技术,我们可以在一次测试中就对一位病人的所有基因进行分析,并且在大多数情况下都可以得到快速诊断。”

但是新一代测序技术给MCRI的数据存储带来不小的压力。该中心打算安装一个数据存储系统以保存和管理大数据,包括下一代测序技术产生的数据。

MCRI已经对该中心现有的117TB存储进行了扩展,然后构建一个预置的存储基础设施平台去支持DNA技术的横向扩展。据了解,该中心使用的是EMC存储技术和Isilon平台,去构建存储基础设施。

该项目的负责人Thomas Dureya将参与存储系统的设计、安装和配置。部署过程即将展开,大约需要几个月的时间完成。

目前该研究所正在对60位病人进行下一代DNA测序技术的测试。据教授Sinclair表示,一旦新平台上线,MCRI可以使用DNA测序技术每年对1000名病人进行测试。

他表示:“孩子们将是使用下一代DNA测序技术的第一批受益人,我们可以在早期检测和诊断出童年时的基因状况。我相信,在不久的将来,对患者的基因测序将影响到所有医学分支。”