具体到措施，综合考虑性价比后，无碍乎：
大容量移动硬盘3块，存储数据库。移动硬盘本身使用文件系统层证书加密（Windows的NTFS，Linux的EXT，OSX的HFS都支持，本身说明这个需求是很普遍的），或者像 @刘佳 和 @Thyme提到的，利用压缩工具的密码保护。对数据安全非常忧虑的，还可以配合文件签名，用来进一步校验数据完整性。
秘钥文件或者密码在组织授权，鉴定过对方接收人员的身份/组织信息后，利用网络中的各种加密传输技术（VPN，HTTPS等等），交到接收方那里。
每块移动硬盘，或走不同的快递服务商，或分批次，或兼而有之，用快件发出。
接收到移动硬盘后，使用密钥或者密码取出文件，有文件签名的，再校验签名。全部通过后，就算传输完成了。
想看更多解决的方式，请看http://www.zhihu.com/question/20541947
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