影响四：预后的影响
研究人员最新调查证据支持基因网络分析可以提供预后信息。例如，加州大学圣迭戈分校(UCSD)的Chang博士和同事们在2012年的《血液》杂志发文：通过单克隆B细胞在血液中、骨髓、次级淋巴组织的集聚，采用基因网络分析并预测慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的特点。
具体地说，研究人员使用subnetwork-based(子网络)基因表达分析概要文件区分组不同患者的慢性淋巴细胞白血病进展风险。 临床患者的慢性淋巴细胞白血病患者有很大的差异：有些病人无症状多年;有些患者则在被诊断后不久就出现较为严重的症状。
由于目前必须明确证据显示疾病进展或疾病相关的并发症，否则建议停止治疗，但标准疗法与显著的毒性有关，因此准确预测是至关重要的。目前已经有通过基因芯片检测的报告显示，替代标记物可作为慢性淋巴细胞白血病已知的预后因素，如IGHV突变状态。
预测子网的表达水平随着时间的推移而发生变化，但是在在之后的时间点表现出较强的相似性。大 数据挖掘 已经成为慢性淋巴细胞白血病患者等癌症的的治疗策略和潜在的观察途径。