1500例食管癌患者基因样本将纳入大数据分析

中国IDC圈12月24日报道:近日,北京协和医学院分子肿瘤学国家重点实验室宣布与百度公司合作,将通过大数据手段对1500例食管癌患者的基因样本进行分析,为食管癌的早期筛查和诊断提供科学依据,并为食管癌药物的研发提供靶标。百度CEO李彦宏以个人名义捐赠3000万元,用于此次研究。这也是国内互联网企业与国家级医学科研机构在癌症研究领域的首次深度合作。

据介绍,长期以来,中国食管癌发病率高居世界首位。全球大约60%以上的食管癌患者都在中国。由于缺乏早期诊断的标志物,大部分患者发现时已是晚期,加上不了解食管癌的发病机理和缺乏有效的临床治疗药物,患者的5年生存率仅为10%左右。

另一方面,我国的食管癌患者95%以上是食管鳞癌,而欧美国家多为食管腺癌,欧美的食管癌研究对中国医学界并无太多借鉴作用。进行食管癌全基因组的测序分析和功能研究,找出食管癌早期诊断的生物标志和药物靶标迫在眉睫。

北京协和医学院分子肿瘤学国家重点实验室主任詹启敏介绍,此次1500名患者的样本量,在全世界范围内是最大的。“一般100多例就算比较大的,几百例就超大数据,1500例是巨大数据。”

北京协和医学院校长曾益新认为,“此次合作对深入了解食管癌的分子机理,提高我国食管癌预警、早期诊断和预防能力具有重要的科学和现实意义。”

詹启敏说,本次合作是一个开端,未来的分析合作可以扩大到糖尿病和心脑血管等疾病,推动疾病的筛查和研究。

李彦宏表示,“计算能力的提高、基因测序成本的下降,都为计算机技术助力生命科学研究带来了新的可能。这次合作是互联网技术与生命科学的一次联手,是大数据、人工智能技术应用于医学研究的一次尝试。不管是对中国的生命科学研究,还是对大数据等互联网技术应用领域的拓展,都是一次非常有价值的探索。”

北京协和医学院分子肿瘤学国家重点实验室副主任刘芝华说,协和医学院的科研团队将负责1500例食管癌患者标本的采集以及100个食管癌家族的全基因组测序等工作。其中,全基因组测序和比对过程中会产生大量数据,这些数据将交由百度公司负责存储,并进行生物学分析与临床相关性分析,以期对食管癌分子预警以及将来的靶点治疗提供帮助。

“肿瘤发生是多因素、多阶段的复杂过程,我们需要借助大数据的力量,多方位来考虑这个问题。”刘芝华说。

据介绍,“百度-北京协和医学院食管癌研究项目”将于2016年年初启动,在两年内完成1500例食管癌患者的组织样本收集,100个食管癌家系血液样本的收集,并将在2017年前完成整个项目的测序和生物分析工作。