随着智慧城市建设的推进，智慧城市建设将进入“深水区”，信息孤岛、信息安全等问题变得更加迫切，亟待解决。
信息孤岛将成为大数据应用的桎梏。由于我国城市、企业的信息化是一个逐步完善的过程，在不同时期分散实施的系统，由于在运行环境、数据库系统、信息编码规则、业务流程定义等方面执行不同的标准，成为系统无法信息共享和集成的根本原因。而且行业发展水平参差不齐，因此信息孤岛在我国是一个普遍问题。但随着智慧中国建设的深入开展，信息孤岛将成为大数据应用的桎梏，若不能解决信息孤岛问题，则智慧中国建设将变成一个个“行业示范应用”，无法真正全面推广。
信息安全将成为大数据应用推广的拦路虎。大数据时代，数据资产化成为趋势，企业内部运行数据和客户资料成为宝贵的数据资产，而且很多智慧城市应用涉及公民财产安全甚至国家安全，数据价值更高，因此信息安全问题成为大数据时代智慧城市建设首要难题。当前政府、企业、个人的数据安全意识也开始增强，2012年12月28日，全国人大常委会第三十次会议通过了《关于加强网络信息保护决定》，该决定将政府、企业、个人信息数据上升到极其重要的法律保护位置，同时对惩处威胁信息安全的行为提供了法律依据。但客观来看，我国信息安全技术水平相对国外先进水平差距依然较大，一些核心软硬件产品依然被国外巨头控制。未来国家的扶持力度将会进一步加大，国内企业将面临更大发展机遇。
三、智慧城市中大数据应用发展建议
1、加强统筹规划，优化大数据形成机制。强化对大数据建设工作的组织协调，打破地区和部门数据壁垒，实现数据资源联合共建、广泛共享。建立政府和社会联动的大数据形成机制，以政府数据公开共享，推动公共数据资源的开发利用。
2、加强数据收集和信息感知，提高城市感知水平。加强政府部门在管理和服务过程中对数据的主动采集，建立政府大数据库。鼓励制造业企业和商业机构加强对生产经营活动中的数据采集，形成覆盖生产过程和商业各环节各流程的数据库。推进无线识别技术、传感器、无线网络、传感网络等新技术的广泛应用，提高数据采集的智能化水平。
3、推进大数据应用，提高经济社会智慧化水平。推进政务信息公开。推行政府网上办事，收集分析挖掘社会政务服务需求，推进公共服务个性化和政府决策智能化。支持公共服务机构和商业机构开放与社会民生密切相关的公共数据。推进国民经济各行业和企业数据开发，发展商业智能。鼓励开展服务大众的大数据应用，提升智慧生活品质。