一、平台锁定。虽然PaaS平台多为开源软件搭建，但其所提供的服务，多为平台特有的服务。比如新浪SAE，集成了完整的OpenAPI的封装，在其之上开发微博应用就非常容易。当然还有其他很多的特定服务，比如新浪提供的KVDB，在线存储等，当你的应用变得越来越复杂，使用的服务越来越多时，你会发现从平台上迁移出去可能会成为一件不太可能的事情。
二、计费模式复杂。不像传统的虚拟主机，VPS，采用一次性买断的价格，简单易懂，当然也其后果是很可能出现浪费或者不够用的情况。PaaS平台的费用计算就复杂的多，流量要单独计费，CPU要单独计费，储存要单独计费，内存要单独计费，如果你购买图片处理服务还需要另的费用，各种计费纷繁复杂。虽然按需计费的概念非常动人，但是这么多的项目，这么抽象的计费概念，在真正投入使用前，很难做到对费用的一个准确的估计。
三、应用环境不成熟。不管是哪个APP Engine都还是Beta或者刚刚去掉Beta的状态。虽然，百度在BAE上构建了上亿访问量的应用，新浪也通过微博验证了SAE承担海量任务的能力。但那是在内部使用的情况下实现的，我有需求，或者什么地方搞不定了，可以去找内部人士解决。作为外部开发者，可以访问和调度在资源显然没有那么大。
即使在应用引擎老大哥Google那边，Google App Engine也没能成为一个主流的开发平台。Google在财报中也几乎没有提到过该项目的营收情况，也没有在该平台上诞生过千万级别的应用。至少到目前为止PaaS并没有成为云计算的主流。
IaaS更靠谱？
到目前为止，最成功的云计算服务要数亚马逊的EC2了。EC2是一个IaaS平台（Infrastructure as a Service，即基础设施即服务），相比于PaaS平台，IaaS平台具有更高的自由度。在EC2的虚拟机里，开发者可以像物理机一样安装所需要的服务，虽然看起来像虚拟主机的升级版，但当这些虚拟机可以被非常方便的控制时，其发挥出的威力却大不一样。
在亚马逊的客户里，我们可以看到Instagram，Netflix，Foursquare等重量级的网络服务，亚马逊的EC2云计算也为其带了丰厚的利润。
不过国内IaaS服务发展并没有非常成熟，现在很多小型网络服务商所提供的所谓云主机，不过是原来虚拟主机的另外一个叫法而已。而阿里，盛大，腾讯的云主机也刚刚起步，百度的IaaS云主机还处于测试阶段，并且云主机价格并不便宜，相比传统的自有产权服务器在成本上优势并不大。
总的来说，对于一些依附于特定平台的小型服务，使用PaaS平台也许是不错的选择。比如为微博开发应用，就用SAE。为淘宝商家开发相应的ERP，那就用阿里的ACE。但PaaS平台，在脱离自己的生态环境以后，其价值就没有那么明显了，有些时候反而会成为应用发展的瓶颈。而具有更高可定制性的IaaS服务，更加适合真正的互联网应用，不过国内IaaS发展还处于初级阶段，其实战能力还没有受到市场的检验。
据报道2013年中国云计算市场规模将达到1174.12亿元人民币，这么大的市场规模，IT巨头们当然不会坐视不管，不过国内的云计算发展水平还并不高，要让云计算真正成为主流应用的基础，还需要假以时日。