一般可以从理论和实验两个方面评估一个生物识别方法的性能指标。从理论方面可以研究生物特征的唯一性，即对影响错误接收和错误拒绝的各种参数进行准确建模，从每种生物特征识别方法的本质和机理出发给出理论上可以取得的错误率的下界。这个工作是很有意义也是难度很大的。例如司法界对通过指纹匹配结果来指认罪犯还存在着很大争议，虽然有研究人员宣称地球上找不到指纹特征完全相同的两个人，但是在自动或者人工指纹识别系统中，到底需要多大的相似度才可以完全确认两枚指纹的同源性？识别出错的准确概率到底是多少？已经有研究人员对这个问题进行了比较深入的研究，但是并没有完全解决好这个问题。