1、指纹产品厂家大多未推出指纹阅读机具，只有少数大型指纹产品生产厂家，其中包括：北京中控生产的U.are.U3000光学指纹阅读器;广州三新生产的ES-3202和ES-3205电容式指纹阅读器;
2、具体应用指纹阅读器为安全认证工具的项目很少，同时也仅限于局部应用。比如：个别县级养老保险机构采用指纹认证实现养老保险金核发依据;个别高安全单位(如：军队)采用指纹认证实现简单的身份认证;
3、统一的指纹信息库形成遥遥无期。作为大型指纹识别认证应用的前提之一就是形成统一的指纹信息库。包括社保、二代证、电子商务、教育、军队、监狱等应用行业或单位都需要形成统一的指纹信息库，以便能顺利推行指纹安全认证。但目前这项工作都未启动，甚至是根本未得到应有的重视;
4、标准化制订滞后。未能及时制定出统一的、可行的国家标准，导致各个指纹产品厂家一方面一味强调自身产品的技术标准，另一方面也不敢大批生产和推广指纹阅读器产品，反倒大力推广指纹应用的低端产品(如：考勤机、门禁控制器等)，于是出现了现在这种指纹低端产品大量涌入市场，而指纹应用的中高端产品和项目难以启动的局面。
但指纹识别认证应用的发展又是必然的，指纹识别认证以其唯一性、安全性等特性与传统的认证方式相比存在无不可比例的技术优势。
目前以下一些行业应用将可能较早采用指纹识别认证方案：
1、高安全要求单位的PC安全认证和内部WEB访问控制
包括一些科研院所、机关、银行以及一些特种行业将首先有可能采用这一技术。
原因包括：
①这些高安全行业采用传统的密码控制方式存在诸多安全隐患。2001年“9.11”事件以后全球均将安全问题提到了很高的位置。同时，信息安全问题也越来越受到更高层的重视，特别是在这些高安全要求的单位;
②由于采用指纹识别认证需要投入大量的开发工作，采用的硬件设备目前成本普遍较高，启动这一项目需要大量的资金，而这些高安全要求单位在资金投入上存在的问题较小，实现可能性较大;