在我国，RFID技术也被应用于食品安全跟踪管理，并得到了众多地方政府的大力支持.
2002年5月农业部发布“动物免疫标示管理办法”规定猪、牛、羊必须佩戴免疫耳标，建立免疫档案管理制度。
在深港实施的《供港食品安全预警与产地全程溯源控制系统》，为确保供港食品安全，系统采用了RFID无线射频识别技术应用于供港食品养殖、生产、加工、运输、批发、口岸查验、零售等各环节。在食品的外包装上加贴RFID电子标签包含食品检测信息、食品生长、生产信息、储运封装信息，香港市民可通过电子标签阅读器，即可追溯到食品的源头等信息，购买食品时将更放心。
在山东寿光蔬菜，在全省范围内，借助山东省质监系统的金质工程网络平台，建立全省食品安全质量数据库，为消费者提供动态、权威的食品质量追溯信息。 四川生猪养殖、浙江水产品出口等都相继建立对食品安全管理的RFID溯源系统，有力地保证了当地食品安全监管。这些试点工程在很大的程度上促进了我国食品安全可追溯体系的建立。
RFID食品安全管理系统架构示意图
电子标签粘贴在食品或食品包装箱上，阅读器与天线相连，传感器与阅读器集成，其读取的数据包通过网络传送到食品安全管理数据库中，而食品供应链中各环节的厂商及产品信息注册到RFID公共服务体系中，基于食品安全管理数据库，通过供应链信息整合，系统提供食品信息服务，食品安全追溯、食品质量评估等多种应用服务。
应用服务
基于食品安全管理数据库和食品供应链信息的整合，系统可以提供以下多种服务。
(1)食品信息服务
用户通过查询可以享受到食品信息服务。餐桌上，可以获得每道菜的原料产地、生产(加工)者、生产日期等信息;超市购物，可以获得所购食品的流动信息和安全信息
(2) 食品安全追溯
一旦爆发疫情，通过食品安全管理系统可以迅速查找到产品销售地、责任人和产品原产地等信息，不仅可以根据食品安全追溯系统找到每件食品的最终的消费者，还可以找到流通或生产加工过程中出现问题的环节，采取相应措施。
(3)终端查询系统
超市作为消费者购买食品的主渠道，消费者可以在超市或厂家提供的RFID电子标签查询终端上，查看所购买食品的信息。
案例项目描述：
在江苏省农科院六合养殖基地内，每头猪耳朵上都有耳标，利用新型电子耳标技术，开发出规模化养殖场数字化管理模式以及溯源系统，里面有RFID标签芯片，类似于居民身份证从一代升级到二代。
RFID电子标签可记录猪个体的关键信息，包括出生时间、饲养情况、出栏时间等，就像一个小小的生产资料库。利用新型耳标可以实现将管理对象编号，实行数字化管理，方便生产管理，还保证上市肉品质量安全信息追溯。目前江苏省阜宁等地已广泛采用生猪耳标，取得较好养殖成效。