速度和延迟：这是一个物理学的基本定律，这是因为远距离数据传输会导致性能下降。
即使云计算服务提供商的数据中心距离较近，并提供SSD硬盘支持的服务和其他高性能存储选项，也不可能超过企业自己的数据中心的数据传输速度。对数据延迟苛刻的关键任务工作负载可能不适合采用混合云存储。
中断：比性能低下情况更糟的是存储服务中断。它可能使某些服务和应用程序依赖存储在公共云上的数据在一段时间无法访问。
安全和合规性问题
确保整个混合云环境中的数据安全性和合规性都保持一致。
企业的内部安全标准、政策和程序必须与其公共云提供商的安全功能保持一致。幸运的是，大多数主要的云计算提供商提供了大量的加密、认证和其他安全控制和集成等服务，以保持敏感的业务信息的安全。
同样，企业所拥有的数据类型也会影响其在哪里存储，希望不会受到监管当局的惩罚。
如果企业处理健康数据，并且正在考虑将其中的一部分移至公共云，则美国健康保险流通与责任法案（HIPAA）是一个考虑因素。如果企业计划放置在公共云上的用户数据中包含信用卡信息，则必须遵守支付卡行业数据安全标准（PCI DSS）。如果企业有欧洲用户，那么欧盟的“一般数据保护条例”（GDPR）不容忽视。
此外，大多数主要的云存储提供商都在为企业提供指导，将企业的产品与适当的安全和合规控制协调一致，以确保企业不会违反行业法规。